ZC3HAV1

ZC3HAV1
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 2X5Y, 4X52
Identifikatori
Aliasi	ZC3HAV1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 607312 MGI: 1926031 HomoloGene: 10585 GeneCards: ZC3HAV1
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 7 (čovjek) Bend 7q34 Početak 139,043,515 bp Kraj 139,132,122 bp
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 6 (miš) Bend 6 B1|6 17.72 cM Početak 38,282,221 bp Kraj 38,331,538 bp
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • vezivanje iona metala • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • vezivanje sa RNK • cadherin binding • NAD+ ADP-ribosyltransferase activity • NAD+ binding • protein ADP-ribosylase activity Ćelijska komponenta • citoplazma • jedro • citosol Biološki proces • positive regulation of interferon-alpha production • immune system process • response to virus • positive regulation of mRNA catabolic process • negative regulation of viral genome replication • positive regulation of RIG-I signaling pathway • defense response to virus • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • Urođeni imunski sistem • positive regulation of interferon-beta production • protein poly-ADP-ribosylation • protein ADP-ribosylation Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	56829	78781
Ensembl	ENSG00000105939	ENSMUSG00000029826
UniProt	Q7Z2W4	Q3UPF5
RefSeq (mRNK)	NM_020119 NM_024625 NM_001363491	NM_028421 NM_028864 NM_001347122
RefSeq (bjelančevina)	NP_064504 NP_078901 NP_001350420	NP_001334051 NP_082697 NP_083140
Lokacija (UCSC)	Chr 7: 139.04 – 139.13 Mb	Chr 6: 38.28 – 38.33 Mb
PubMed pretraga
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

WEE2-antisens RNK 1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom WEE2-AS1.

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 902 aminokiseline, а molekulska težina 101.431 Da.

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MADPEVCCFI		TKILCAHGGR		MALDALLQEI		ALSEPQLCEV		LQVAGPDRFV
VLETGGEAGI		TRSVVATTRA		RVCRRKYCQR		PCDNLHLCKL		NLLGRCNYSQ
SERNLCKYSH		EVLSEENFKV		LKNHELSGLN		KEELAVLLLQ		SDPFFMPEIC
KSYKGEGRQQ		ICNQQPPCSR		LHICDHFTRG		NCRFPNCLRS		HNLMDRKVLA
IMREHGLNPD		VVQNIQDICN		SKHMQKNPPG		PRAPSSHRRN		MAYRARSKSR
DRFFQGSQEF		LASASASAER		SCTPSPDQIS		HRASLEDAPV		DDLTRKFTYL
GSQDRARPPS		GSSKATDLGG		TSQAGTSQRF		LENGSQEDLL		HGNPGSTYLA
SNSTSAPNWK		SLTSWTNDQG		ARRKTVFSPT		LPAARSSLGS		LQTPEAVTTR
KGTGLLSSDY		RIINGKSGTQ		DIQPGPLFNN		NADGVATDIT		STRSLNYKST
SSGHREISSP		RIQDAGPASR		DVQATGRIAD		DADPRVALVN		DSLSDVTSTT
SSRVDDHDSE		EICLDHLCKG		CPLNGSCSKV		HFHLPYRWQM		LIGKTWTDFE
HMETIEKGYC		NPGIHLCSVG		SYTINFRVMS		CDSFPIRRLS		TPSSVTKPAN
SVFTTKWIWY		WKNESGTWIQ		YGEEKDKRKN		SNVDSSYLES		LYQSCPRGVV
PFQAGSRNYE		LSFQGMIQTN		IASKTQKDVI		RRPTFVPQWY		VQQMKRGPDH
QPAKTSSVSL		TATFRPQEDF		CFLSSKKYKL		SEIHHLHPEY		VRVSEHFKAS
MKNFKIEKIK		KIENSELLDK		FTWKKSQMKE		EGKLLFYATS		RAYVESICSN
NFDSFLHETH		ENKYGKGIYF		AKDAIYSHKN		CPYDAKNVVM		FVAQVLVGKF
TEGNITYTSP		PPQFDSCVDT		RSNPSVFVIF		QKDQVYPQYV		IEYTEDKACV
IS

Funkcija

U jednoj studiji iz 2020., konstatirano je da dugolančane nekodirajuće RNK (lncRNK) utiču na aterosklerozu, regulirajući fiziološke i patološke procese endotelnih ćelija. Međutim, uloga lncRNA WEE2 antisens RNK 1 (WEE2 AS1) u obliteranskoj arteriosklerozi (ASO) nije u potpunosti shvaćena. Ova je studija istraživala je funkciju lncRNK WEE2 AS1 u endotelnim ćelijama ljudskih krvnih sudova. Rezultati su pokazali da je lncRNK WEE2 AS1 značajno povišena u uzorcima tkiva plazme i arterija kod pacijenata s ASO, u poređenju sa zdravim kontrolnim osobma. Nalazi fluorescentne hibridizacije in situ sugerirali su da je lncRNK WEE2 AS1 eksprimirana u citoplazmi i jedrima primarnih ljudskih endotelnih ćelija iz pupčane vene (HUVEC).

Rezultati testa za prebrojavanje ćelija 8, sugerirali su da je nokdauniranje lncRNA WEE2 AS1 značajno poboljšalo održivost HUVEC -a, dok je prekomjerna ekspresija lncRNK WEE2 AS1 inhibirala održivost HUVEC-a u usporedbi s negativnim kontrolnim skupinama. Nadalje, analiza ćelijskoog ciklusa protočnom citometrijom pokazala je da je nokdauniranje lncRNK WEE2 AS1 značajno smanjilo udio ćelija u G0/G1 fazi i značajno povećalo njihov udio u G2/M fazi u usporedbi s negativnom kontrolnom skupinom. Međutim, prekomjerna ekspresija lncRNK WEE2 AS1 nije imala značajan uticaj na distribuciju ćelijskog ciklusa u usporedbi s negativnom kontrolnom skupinom.

Rezultati Western blot-a pokazali su da je nokdaun lncRNK WEE2 AS1 značajno smanjio nivoe ekspresije fosforilirane ciklin-zavisne kinaze 1, WEE1 homologa 2 i mijelinskog transkripcijskog faktora 1, ali je povećao nivo ekspresije diobe 25B ćelijskog ciklusa u usporedbi s negativnom kontrolnom grupom. Prekomjerna ekspresija lncRNA WEE2 AS1 pokazala je suprotan učinak na ekspresiju proteina. Zajedno, ova studija sugerirala je da je lncRNK WEE2 AS1 značajno regulirana u ASO -u i da može poslužiti u regulaciji održivosti vaskularnih endotelnih ćelija.

Daljnje istraživanje lncRNK WEE2 AS1 moglo bi proširiti sadašnje razumijevanje molekulnog mehanizma u osnovi ASO-a i pomoći u identifikaciji specifičnih sondi i precizno ciljanih lijekova za dijagnostiku i liječenje ASO.