SIRPA

SIRPA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2JJS, 2JJT, 2UV3, 2WNG, 4CMM
Ідентифікатори
Символи	SIRPA, BIT, CD172A, MFR, MYD-1, P84, PTPNS1, SHPS1, SIRP, Signal-regulatory protein alpha, signal regulatory protein alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 602461 MGI: 108563 HomoloGene: 7246 GeneCards: SIRPA
Онтологія гена
Молекулярна функція	• SH3 domain binding; • зв'язування з протеїнфосфатазою; • GO:0005083 GTPase regulator activity; • protein binding involved in heterotypic cell-cell adhesion; • cell-cell adhesion mediator activity; • protein antigen binding; • protein tyrosine kinase binding;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • клітинна мембрана; • екзосома; • мембрана; • tertiary granule membrane; • ficolin-1-rich granule membrane; • інтегральний компонент плазматичної мембрани; • поверхня клітини;
Біологічний процес	• адгезія клітин; • leukocyte migration; • дегрануляція нейтрофілів; • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation; • регуляція експресії генів; • cell migration; • positive regulation of cell-cell adhesion; • regulation of interferon-gamma production; • regulation of interleukin-1 beta production; • regulation of interleukin-6 production; • regulation of tumor necrosis factor production; • negative regulation of interferon-beta production; • negative regulation of interleukin-6 production; • negative regulation of tumor necrosis factor production; • heterotypic cell-cell adhesion; • monocyte extravasation; • negative regulation of nitric oxide biosynthetic process; • regulation of nitric oxide biosynthetic process; • negative regulation of JNK cascade; • negative regulation of inflammatory response; • negative regulation of phagocytosis; • positive regulation of phagocytosis; • GO:0048552 regulation of catalytic activity; • positive regulation of T cell activation; • cellular response to hydrogen peroxide; • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • cellular response to lipopolysaccharide; • cellular response to interferon-gamma; • cellular response to interleukin-1; • cellular response to interleukin-12; • negative regulation of macrophage inflammatory protein 1 alpha production; • negative regulation of chemokine (C-C motif) ligand 5 production; • cell-cell adhesion; • negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response; • negative regulation of I-kappaB phosphorylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	140885
	19261
	ENSG00000198053
	ENSMUSG00000037902
	P78324
	P97797
	NM_001040022; NM_001040023; NM_080792; NM_001330728
NM_001177646; NM_001177647; NM_001291019; NM_001291020; NM_001291021;
	NM_001291022; NM_007547; NM_001355158; NM_001355160
	NP_001035111; NP_001035112; NP_001317657; NP_542970
NP_001171118; NP_001277948; NP_001277949; NP_001277950; NP_001277951;
	NP_031573; NP_001342087; NP_001342089
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SIRPA (англ. Signal regulatory protein alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 504 амінокислот, а молекулярна маса — 54 967^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPAGPAPGR	LGPLLCLLLA	ASCAWSGVAG	EEELQVIQPD	KSVLVAAGET
ATLRCTATSL	IPVGPIQWFR	GAGPGRELIY	NQKEGHFPRV	TTVSDLTKRN
NMDFSIRIGN	ITPADAGTYY	CVKFRKGSPD	DVEFKSGAGT	ELSVRAKPSA
PVVSGPAARA	TPQHTVSFTC	ESHGFSPRDI	TLKWFKNGNE	LSDFQTNVDP
VGESVSYSIH	STAKVVLTRE	DVHSQVICEV	AHVTLQGDPL	RGTANLSETI
RVPPTLEVTQ	QPVRAENQVN	VTCQVRKFYP	QRLQLTWLEN	GNVSRTETAS
TVTENKDGTY	NWMSWLLVNV	SAHRDDVKLT	CQVEHDGQPA	VSKSHDLKVS
AHPKEQGSNT	AAENTGSNER	NIYIVVGVVC	TLLVALLMAA	LYLVRIRQKK
AQGSTSSTRL	HEPEKNAREI	TQDTNDITYA	DLNLPKGKKP	APQAAEPNNH
TEYASIQTSP	QPASEDTLTY	ADLDMVHLNR	TPKQPAPKPE	PSFSEYASVQ
VPRK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

Sano S., Ohnishi H., Kubota M. (1999). Gene structure of mouse BIT/SHPS-1. Biochem. J. 344: 667—675. PMID 10585853 doi:10.1042/bj3440667
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Brooke G.P., Parsons K.R., Howard C.J. (1998). Cloning of two members of the SIRP alpha family of protein tyrosine phosphatase binding proteins in cattle that are expressed on monocytes and a subpopulation of dendritic cells and which mediate binding to CD4 T cells. Eur. J. Immunol. 28: 1—11. PMID 9485180 doi:10.1002/(SICI)1521-4141(199801)28:01<1::AID-IMMU1>3.3.CO;2-M
Stofega M.R., Argetsinger L.S., Wang H., Ullrich A., Carter-Su C. (2000). Negative regulation of growth hormone receptor/JAK2 signaling by signal regulatory protein alpha. J. Biol. Chem. 275: 28222—28229. PMID 10842184 doi:10.1074/jbc.M004238200
Hatherley D., Harlos K., Dunlop D.C., Stuart D.I., Barclay A.N. (2007). The structure of the macrophage signal regulatory protein alpha (SIRPalpha) inhibitory receptor reveals a binding face reminiscent of that used by T cell receptors. J. Biol. Chem. 282: 14567—14575. PMID 17369261 doi:10.1074/jbc.M611511200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9662 (англ.) . Архів оригіналу за 3 лютого 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-02-03 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P78324 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9662 (англ.) . Архів оригіналу за 3 лютого 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-02-03 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P78324 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350